It is narrated from Qais (may Allah be pleased with him) that he said: The Messenger of Allah (ﷺ) saw me performing two rak‘ahs after the morning prayer and said: "O Qais, what are these two rak‘ahs?" (Qais says) I replied: I had not performed the two Sunnah rak‘ahs of Fajr. (Upon hearing this) the Messenger of Allah (ﷺ) remained silent.
Hadith Referenceمسند الإمام الشافعي / كتاب الصلاة / 161
Hadith Takhrijأخرجه أبو داود، التطوع، باب من فاتته متى يقضيها: 1267 - والترمذي، الصلاة، باب ما جاء فيمن تفوته الرکعتان قبل الفجر يصليهما بعد صلاة الصبح: 422 - وصححه ابن خزيمة: 1116 - وابن حبان: 624.